ImageJ – תוכנה לנתח ולעבד את קבצי תמונה. התוכנה מסוגלת לנתח את התמונה בצורה יעילה ולקבל את הנתונים טכניים המפורטים. ImageJ תומך ברוב פורמטי התמונה ויש לו סט של כלי עריכה. התוכנה מאפשרת לייצר התמורות גיאומטריות שונות, ליצור היסטוגרמות צפיפות, לנהל הדמיית 3D, לבצע את פעולות לוגיות וחשבון בין תמונות, וכו ’ImageJ הוא מסוגל לעבוד בו זמנית עם מספר רב של תמונות, להחיל את מסננים שונים ולבצע עיבוד אצווה של קבצים. ImageJ מכיל הרבה plagins שבגדול להרחיב את היכולות של התוכנה.